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如何使用 gene expression omnibus 检索

发布网友 发布时间:2022-04-26 02:12

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热心网友 时间:2022-06-19 22:55

GEO是一个高通量芯片表达谱数据库,允许high-throughput gene expression/genomic hybridization/antibody array experiments等方式获取的数据信息的提交/存取/检索,GEO作为信息数据集中和发布的hub,是传统实验室数据资源的有效补充。
  GEO的三个入口:
  GPL Platforms (平台):关于用于以高通量方式(microarray, SAGE)检查样本的物理试剂的信息。一个平台含有多个提交者提交的样本。
  GSM Samples (样本):关于被检查的mRNA样本,实验条件,和实验产生的基因表达测量数据信息。一个样本必须涉及一个平台,可能会包括在许多系列之中。
  GSE Series (系列):样本收集,样本是如何相关的,如何排序的,分析是如何进行的,和聚类数据是如何获得的信息。系列含有数据的摘要信息。转载,仅供参考。

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